针对特定目标蛋白,精准定位泛素化修饰发生的精确赖氨酸残基。Aimsmass 基于泛素 remnant(di-Gly)标记策略与高分辨 LC-MS/MS 平台,为泛素-蛋白酶体系统和信号调控研究提供分子水平的确切证据。
泛素化是一种功能强大的蛋白翻译后修饰,最为人知的是其在蛋白降解中的作用。泛素-蛋白酶体系统(UPS)通过 E1(激活酶)、E2(结合酶)、E3(连接酶)的酶级联反应,将泛素(76 个氨基酸,8.5 kDa)标记到目标蛋白的赖氨酸残基上。去泛素化酶(DUB)可逆转这一过程。
蛋白底物可发生多种泛素化模式:单一泛素化(monoubiquitination)、多单泛素化(multi-monoubiquitination)和多聚泛素化(polyubiquitination)。多聚泛素链可通过泛素分子上 7 个赖氨酸残基(K6、K11、K27、K29、K33、K48、K63)或 Met1 连接,形成不同链类型,各有不同的生物学功能。其中 K48 链主要介导蛋白酶体降解,K63 链参与信号转导和 DNA 修复。
泛素化位点鉴定的核心目标是:在已知的特定蛋白上,精确鉴定泛素化发生在哪一个赖氨酸残基上,并利用 di-Gly remnant 策略确认修饰位点。
蛋白泛素化有多种模式,在生物学功能和检测方法上各有不同:
单泛素化:单个泛素分子连接在底物蛋白的一个赖氨酸残基上
多单泛素化:多个赖氨酸残基各连接一个泛素分子
生物学功能:膜蛋白内吞、DNA 修复、组蛋白调控、蛋白分选
检测特点:di-Gly remnant 策略直接定位修饰位点
同型多聚泛素化:泛素链通过同一赖氨酸残基(K48/K63 等)连接
异型多聚泛素化:泛素链通过不同赖氨酸残基混合连接
链类型功能:K48-蛋白酶体降解、K63-信号转导/DNA 修复、K11-细胞周期
检测特点:可结合链特异性抗体或 UB chain restriction analysis
泛素化位点鉴定利用泛素 remnant(di-Gly)策略:胰蛋白酶酶切后,泛素化的赖氨酸残基上会保留一个二甘氨酸(di-Gly, +114.043 Da)标记,通过抗 di-Gly 抗体富集修饰肽段后进行 LC-MS/MS 分析。标准流程如下:
利用泛素 remnant(di-Gly, +114.043 Da)标记精确定位泛素化赖氨酸位点,方法成熟、特异性高。
可分析不同种类的聚泛素化类型(K48、K63、K11 等),揭示泛素化修饰的生物学功能。
针对已知目标蛋白进行定向分析,结果精确到具体赖氨酸残基。
采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统,确保 di-Gly remnant 检测的灵敏度和位点定位精度。
常规动物组织:100mg
软体动物组织:1g
常规植物组织:1g
植物果实及种子:2g-4g
细胞样本:2×107
菌类样本:150mg
最低蛋白质量:1mg
检测平台:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统
位点鉴定因针对特定蛋白,样本量要求相对灵活,支持血清、重组蛋白等特殊样本,具体请咨询技术团队。
详细送样指南请参考 送样准备。
位点鉴定针对已知的特定目标蛋白,精准定位泛素化发生在哪个赖氨酸残基上。蛋白质组学则在全蛋白水平进行系统性泛素化分析,适合发现新的泛素化底物。已知目标蛋白选位点鉴定,探索未知选蛋白质组学。
胰蛋白酶酶切泛素化蛋白后,泛素化的赖氨酸残基上会保留一个二甘氨酸(Gly-Gly, di-Gly)remnant,质量偏移为 +114.043 Da。通过抗 di-Gly 抗体特异性富集这些修饰肽段,再用 LC-MS/MS 鉴定,即可精确定位泛素化位点。
常规动物组织 100mg,细胞样本 2×107 个,最低蛋白质量 1mg。支持 SDS-PAGE 胶条和蛋白溶液样本。建议使用泛素化蛋白酶体抑制剂(如 MG132)处理样本以提高泛素化信号。
不同链类型(K48、K63 等)可通过泛素链限制性分析或链特异性抗体来区分。质谱方法中,不同链类型产生的 di-Gly 修饰肽段可反映连接位点。如需链类型分析,请在送样时说明。
标准交付周期约 1-2 周。交付内容包括:原始质谱数据、泛素化位点定位结果表、修饰肽段序列、关键质谱谱图。
如需在全蛋白水平进行系统性泛素化分析,或对其他修饰类型进行研究,可参考以下服务:
提交咨询,Aimsmass 技术团队将根据您的目标蛋白和研究目的,定制精准的泛素化位点鉴定方案与报价。
获取位点鉴定方案与报价电话:021-51914748 | 邮箱:info@aimsmass.cn