本页面是甲基化「位点鉴定」服务入口。如果您已有明确的目标蛋白，需要精确定位其上的甲基化修饰位点，请在此选择对应服务。如需在全蛋白水平进行系统性甲基化分析，请访问 甲基化蛋白质组学。
甲基化作为最重要的蛋白翻译后修饰之一，在调控信号转导、DNA 损伤修复、转录调控、基因激活与表达等过程中起着至关重要的作用。组蛋白甲基化通常发生在赖氨酸或精氨酸残基上：赖氨酸可发生单甲基化（me1）、二甲基化（me2）和三甲基化（me3），由赖氨酸甲基转移酶（KMT）以 S-腺苷甲硫氨酸（SAM）为甲基供体催化；精氨酸可发生单甲基化和对称/非对称二甲基化，由精氨酸甲基转移酶（PRMT）催化。
甲基化的动态调控类似于磷酸化，遵循"书写-阅读-擦除"机制：KMT/PRMT 作为书写者（writer）催化甲基化，含特定结构域（如 chromodomain、Tudor domain）的蛋白作为阅读者（reader）识别甲基化信号，去甲基化酶（如 LSD、JMJD）作为擦除者（eraser）去除甲基化修饰。
除组蛋白外，非组蛋白的赖氨酸和精氨酸甲基化在 MAPK、WNT、BMP、JAK-STAT 等信号通路中也起重要调控作用。甲基化位点鉴定的核心目标是：在已知的特定蛋白上，精确鉴定甲基化位点及其甲基化程度（me1/me2/me3）。
赖氨酸甲基化与精氨酸甲基化
蛋白甲基化主要发生在两类氨基酸残基上，在修饰程度和调控机制上各有特点：
赖氨酸甲基化
连接位点：赖氨酸（Lys）残基的 ε-氨基
修饰程度：单甲基化（me1）、二甲基化（me2）、三甲基化（me3）
催化酶：赖氨酸甲基转移酶（KMT），以 SAM 为甲基供体
去修饰酶：LSD1/2、JMJD 家族去甲基化酶
典型位点：H3K4me3（转录激活）、H3K27me3（转录沉默）、H3K9me3（异染色质）
KMTme1/me2/me3LSD/JMJD表观遗传
精氨酸甲基化
连接位点：精氨酸（Arg）残基的胍基
修饰程度：单甲基化（MMA）、对称二甲基化（SDMA）、非对称二甲基化（ADMA）
催化酶：精氨酸甲基转移酶（PRMT1-9）
去修饰酶：JMJD6、PAD4
典型蛋白：组蛋白 H4（PRMT1）、Sm 蛋白（PRMT5）、RNA 结合蛋白
PRMTMMA/SDMA/ADMARNA 加工信号转导
技术方案
甲基化位点鉴定针对特定目标蛋白，通过 LC-MS/MS 分析精确定位修饰位点及甲基化程度。标准流程如下：
蛋白提取目标蛋白纯化/SDS-PAGE 分离
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酶切消化凝胶或溶液内胰蛋白酶酶解
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肽段富集甲基化肽段免疫亲和富集（可选）
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LC-MS/MS高分辨质谱采集
→
位点定位甲基化位点及程度确认
服务优势
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多修饰程度同步分析
一次实验同时检测单甲基化（+14.016 Da）、二甲基化（+28.031 Da）和三甲基化（+42.047 Da），全面覆盖甲基化程度。
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赖氨酸/精氨酸同步覆盖
同时分析赖氨酸和精氨酸甲基化位点，覆盖两种主要甲基化类型。
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靶向精准
针对已知目标蛋白进行定向分析，结果精确到具体氨基酸残基及其甲基化程度。
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高分辨质谱平台
采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪（分辨率 240,000 @ m/z 200，扫描速度 40 Hz），搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统，精确区分 me1/me2/me3 的质量差异，确保位点定位精度。
送样要求
常规动物组织：100mg
软体动物组织：1g
常规植物组织：1g
植物果实及种子：2g-4g
细胞样本：2×107
菌类样本：150mg
最低蛋白质量：1mg
检测平台：Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪（分辨率 240,000 @ m/z 200，扫描速度 40 Hz），搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统
位点鉴定因针对特定蛋白，样本量要求相对灵活，支持血清、重组蛋白等特殊样本，具体请咨询技术团队。
详细送样指南请参考 送样准备。
常见问题
甲基化位点鉴定和甲基化蛋白质组学有什么区别？
位点鉴定针对已知的特定目标蛋白，精准定位甲基化位点并确定甲基化程度（me1/me2/me3），适用于验证性研究。蛋白质组学则在全蛋白水平进行系统性甲基化分析，适合探索性研究。已知目标蛋白选位点鉴定，探索未知选蛋白质组学。
如何区分单甲基化、二甲基化和三甲基化？
三种甲基化程度的质量偏移不同：me1 = +14.016 Da，me2 = +28.031 Da，me3 = +42.047 Da。高分辨质谱可精确区分这些质量差异。赖氨酸可同时存在三种程度，精氨酸只有 me1 和 me2（对称或非对称）。
送样要求是什么？
常规动物组织 100mg，细胞样本 2×107 个，最低蛋白质量 1mg。支持 SDS-PAGE 胶条和蛋白溶液样本。组蛋白甲基化分析建议提供 ≥ 50μg 组蛋白提取物。
项目周期多长？
标准交付周期约 1-2 周。交付内容包括：原始质谱数据、甲基化位点定位结果表（含位点置信度和甲基化程度）、修饰肽段序列、关键质谱谱图。
组蛋白和非组蛋白甲基化分析方法相同吗？
基本流程相似，但前处理有所不同。组蛋白分析通常先进行酸提取富集组蛋白，再进行酶解和质谱分析。非组蛋白分析则需要针对目标蛋白进行免疫沉淀或 SDS-PAGE 分离。两者的质谱采集和数据分析流程一致。
相关服务
如需在全蛋白水平进行系统性甲基化分析，或对其他修饰类型进行研究，可参考以下服务：
