针对特定目标蛋白,精准定位丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr)磷酸化修饰发生的精确残基。Aimsmass 基于 TiO2/IMAC 磷酸肽富集与高分辨 LC-MS/MS 平台,为信号转导和激酶调控研究提供分子水平的确切证据。
蛋白磷酸化是最为广泛、研究最为深入的翻译后修饰之一。磷酸化过程在生物体中是可逆的,通过蛋白激酶(kinase)和蛋白磷酸酶(phosphatase)协同调控。据估计细胞中约 1/3 的蛋白同时发生磷酸化,所有生命过程都通过此修饰直接或间接调控。
真核磷酸化位点主要发生在丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)和酪氨酸(Tyr),其中丝氨酸磷酸化占比最高(约 86%),苏氨酸约 12%,酪氨酸约 2%。原核磷酸化则主要发生在组氨酸(His)、精氨酸(Arg)和赖氨酸(Lys)。磷酸化修饰通过分子开关机制,影响蛋白酶活性、蛋白互作、亚细胞定位、构象变化和蛋白稳定性。
磷酸化位点鉴定的核心目标是:在已知的特定蛋白上,精确鉴定磷酸化发生在哪一个 Ser/Thr/Tyr 残基上,为激酶-底物关系验证和信号通路研究提供确凿证据。
真核蛋白磷酸化主要发生在三种氨基酸残基上,各有不同的研究策略和生物学意义:
连接位点:丝氨酸(Ser)或苏氨酸(Thr)残基的羟基
占比:所有磷酸化位点的 ~98%(Ser ~86%, Thr ~12%)
催化酶:Ser/Thr 激酶(如 AKT、MAPK、CDK、PKA 等)
质量偏移:+79.966 Da(HPO3)
分析特点:丰度较高,TiO2/IMAC 富集效果好,位点定位相对容易
连接位点:酪氨酸(Tyr)残基的酚羟基
占比:所有磷酸化位点的 ~2%,但信号意义重大
催化酶:酪氨酸激酶(如 EGFR、Src、ABL、JAK 等)
质量偏移:+79.966 Da(HPO3)
分析特点:丰度低,需抗 pTyr 抗体或 SH2 结构域富集,位点鉴定难度大
磷酸化位点鉴定针对特定目标蛋白,通过磷酸肽特异性富集后进行 LC-MS/MS 分析,精确定位修饰位点。标准流程如下:
一次实验同时检测丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸磷酸化位点,覆盖三种主要磷酸化类型。
针对已知目标蛋白进行定向磷酸化分析,结果精确到具体氨基酸残基,直接服务于激酶-底物关系验证。
可选 TiO2、IMAC、抗 pTyr 抗体等多种磷酸肽富集方法,针对不同磷酸化类型优化检测效果。
采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统,确保磷酸化肽段检测的灵敏度和位点定位精度(localization probability ≥ 0.75)。
常规动物组织:100mg
软体动物组织:1g
常规植物组织:1g
植物果实及种子:2g-4g
细胞样本:2×107
菌类样本:150mg
最低蛋白质量:1mg
检测平台:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统
位点鉴定因针对特定蛋白,样本量要求相对灵活,支持血清、重组蛋白等特殊样本,具体请咨询技术团队。
详细送样指南请参考 送样准备。
位点鉴定针对已知的特定目标蛋白,精准定位磷酸化发生在哪个 Ser/Thr/Tyr 残基上。蛋白质组学则在全蛋白水平进行系统性磷酸化分析,适合探索激酶调控网络和发现新位点。已知目标蛋白选位点鉴定,探索未知选蛋白质组学。
酪氨酸磷酸化仅占所有磷酸化事件的约 2%,丰度远低于 Ser/Thr 磷酸化。此外,酪氨酸激酶的底物通常是低丰度信号蛋白。因此需要更大量的起始样本和特异性富集策略(如抗 pTyr 抗体免疫沉淀或 SH2 结构域亲和)。
常规动物组织 100mg,细胞样本 2×107 个,最低蛋白质量 1mg。支持 SDS-PAGE 胶条和蛋白溶液样本。酪氨酸磷酸化分析建议提供 ≥ 500μg 蛋白起始量。
采用 Ascore 或 PTM-Score 等算法评估位点定位概率。 localize 置信度 ≥ 0.75 被认为是可靠定位。HCD 碎裂产生的中性丢失(-98 Da, H3PO4)和特征碎片离子用于确认磷酸化位点。
标准交付周期约 1-2 周。交付内容包括:原始质谱数据、磷酸化位点定位结果表(含定位概率)、修饰肽段序列、关键质谱谱图。
如需在全蛋白水平进行系统性磷酸化分析,或对其他修饰类型进行研究,可参考以下服务:
提交咨询,Aimsmass 技术团队将根据您的目标蛋白和研究目的,定制精准的磷酸化位点鉴定方案与报价。
获取位点鉴定方案与报价电话:021-51914748 | 邮箱:info@aimsmass.cn