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AIMS 专业服务

蛋白翻译后修饰位点鉴定

针对特定目标蛋白,精准定位修饰发生的精确氨基酸残基。Aimsmass 基于 LC-MS/MS 高分辨质谱平台,提供 16 种以上修饰类型的靶向位点鉴定服务,帮助研究者从肽段水平确认修饰位点,为功能验证和机制研究提供确切证据。

24+可检测修饰类型
~1 周标准交付周期
3 种可一次联检修饰
首页 / 定制服务 / 蛋白修饰位点鉴定

本页面是蛋白修饰「位点鉴定」服务的目录入口。如果您已有明确的目标蛋白,需要精确定位其上的修饰位点,请在此选择对应服务。如需在全蛋白水平进行系统性修饰全景分析,请访问 蛋白质组学服务。

蛋白翻译后修饰(PTM)是蛋白质在翻译过程中发生的共价化学修饰,几乎参与所有细胞生物学和疾病机制过程。位点鉴定的核心目标是:在已知的特定蛋白上,精确鉴定修饰发生在哪一个氨基酸残基上,从而为后续的功能研究和药物开发提供分子水平的确凿证据。

Aimsmass 深耕蛋白修饰质谱领域多年,基于 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统,已建立起覆盖半胱氨酸修饰、化学蛋白质修饰和抗体富集蛋白质组学三大技术路线的位点鉴定服务体系。针对每种修饰类型,均可提供靶向鉴定方案——只需提供目标蛋白信息,即可获得精确到肽段水平的修饰位点数据。

如何选择位点鉴定还是蛋白质组学?

在开始实验前,请根据您的研究目标选择合适的服务类型:

对比维度 位点鉴定(本页面) 蛋白质组学
目标蛋白 已知,有明确研究对象 未知 / 全蛋白水平探索
样本量 较少即可 需更多样本
产出结果 精确到肽段的修饰位点 全修饰景观图谱
交付周期 ~1 周 2-3 周
适用场景 验证已知蛋白的修饰位点、功能研究 发现新修饰位点、系统性全景分析

如需蛋白质组学服务,请访问 蛋白质组学服务目录页,或在下方各服务条目中点击"组学分析"链接。

可检测修饰类型

以下为 Aimsmass 目前支持的全部蛋白修饰位点鉴定服务,按技术路线分为三大类。每种修饰均标注了位点鉴定和组学分析两个入口,可根据研究需求选择。

一、半胱氨酸修饰

以半胱氨酸残基为修饰位点的一类翻译后修饰,涉及氧化还原信号、脂质锚定等生物学过程。

二、化学蛋白质修饰

基于化学反应原理的蛋白修饰鉴定,涵盖脂质修饰、小分子共价修饰及新型非酶促修饰。

  • 靶向控制膜蛋白,调控 Ras 等信号蛋白定位
    适用于:Ras 等信号蛋白的异戊烯化修饰位点确认
  • PAD 酶催化的精氨酸脱亚胺修饰
    适用于:自身免疫疾病相关蛋白的瓜氨酸化位点检测
  • 衣康酸化
    免疫代谢中的新型半胱氨酸修饰
    适用于:免疫代谢研究中特定蛋白的衣康酸化修饰鉴定
  • N-豆蔻酰化
    蛋白 N 端脂质锚定修饰
    适用于:确认特定蛋白 N 端的豆蔻酰化脂质修饰
  • 神经递质相关蛋白共价修饰
    适用于:神经科学研究中特定蛋白的多巴胺共价修饰检测
  • 同型半胱氨酸化
    心血管风险因子相关的蛋白修饰
    适用于:心血管疾病相关蛋白的同型半胱氨酸化分析
  • 血清素化
    转酰胺酶催化的新型单胺修饰
    适用于:转酰胺酶相关研究中特定蛋白的血清素化检测

三、抗体富集类修饰

利用修饰特异性抗体进行免疫亲和富集,结合 LC-MS/MS 实现高通量修饰位点鉴定与定量分析。

  • 改变蛋白构象,激活/失活催化活性
    适用于:已知激酶底物或信号蛋白,需精确定位磷酸化位点
  • 目标蛋白的降解标记与信号调控
    适用于:确认特定蛋白的泛素化修饰位点与降解机制
  • 亚细胞定位与蛋白相互作用调控
    适用于:特定蛋白的 SUMO 化修饰位点定位与功能验证
  • 影响蛋白构象和与其他蛋白亲和性
    适用于:组蛋白或非组蛋白的乙酰化位点精确鉴定
  • 影响蛋白构象和与其他蛋白亲和性
    适用于:组蛋白或转录因子的甲基化修饰位点确认
  • 代谢调控的新型赖氨酸修饰
    适用于:代谢重编程研究中特定蛋白的乳酸化位点检测
  • 琥珀酰化
    三羧酸循环代谢物驱动的新型修饰
    适用于:线粒体代谢相关蛋白的琥珀酰化修饰分析
  • 巴豆酰化
    组蛋白新型酰化修饰
    适用于:表观遗传研究中组蛋白巴豆酰化位点鉴定
  • 3-羟基丁酰化
    酮体代谢驱动的表观遗传修饰
    适用于:酮体代谢条件下特定蛋白的 3-羟基丁酰化检测
  • 脯氨酸/赖氨酸羟化与胶原代谢
    适用于:胶原蛋白或 HIF 通路蛋白的羟基化位点分析
  • 赖氨酸丙酰化
    新型赖氨酸酰化修饰
    适用于:新型酰化修饰研究中特定蛋白的丙酰化位点检测
  • 非模板型修饰,同一位点多种糖型微观异质性,肿瘤/免疫标志物
    适用于:肿瘤标志物筛选、生物药糖型评价、N/O 糖基化全局分析

蛋白修饰功能分类

除了按技术路线分类,蛋白翻译后修饰也可以按其对蛋白功能的生物学影响来划分。下图概括了主要修饰类型的功能定位,便于从生物学问题出发选择适合的研究方向:

蛋白翻译后修饰功能分类总览图
  • 磷酸化

    改变蛋白构象;激活/失活催化活性

  • 泛素化

    目标蛋白的降解标记与信号调控

  • 乙酰化

    影响蛋白构象和与其他蛋白亲和性

  • 甲基化

    影响蛋白构象和与其他蛋白亲和性

  • 棕榈酰化

    影响蛋白定位与膜结合能力

  • 二硫键

    蛋白亚基构成与蛋白高级结构

  • SUMO 化

    亚细胞定位与蛋白相互作用

  • S-亚硝基化

    影响蛋白折叠与氧化还原信号

  • S-异戊烯化

    靶向控制膜蛋白,调控 Ras 等信号蛋白

已有目标蛋白? 提交咨询,Aimsmass 技术团队将为您定制靶向位点鉴定方案。如尚不确定研究方向,也可 浏览蛋白质组学服务 了解全局分析方案。

服务流程

标准蛋白修饰位点鉴定流程如下,约一周可交付数据结果:

样本准备蛋白提取与质控
→
修饰富集抗体/化学法富集
→
酶切消化肽段制备
→
LC-MS/MS高分辨质谱检测
→
数据分析位点鉴定与定量
Aimsmass蛋白修饰位点鉴定服务流程图

服务优势

  • 靶向精准

    针对已知目标蛋白进行定向修饰位点检测,结果精确到具体氨基酸残基,直接服务于功能验证研究。

  • 快速高效

    仅需提供足量蛋白,可同时一次分析最多 3 种修饰。实验前准备简单,标准周期约一周即可交付数据。

  • 覆盖广泛

    可检测 16 种以上修饰类型,只需知道具体修饰基团分子量即可进行研究探索。

Aimsmass蛋白修饰位点鉴定服务优势示意图

送样要求

常规动物组织:100mg

软体动物组织:1g

常规植物组织:1g

植物果实及种子:2g-4g

细胞样本:2×107

菌类样本:150mg

最低蛋白质量:1mg

检测平台:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统

位点鉴定因针对特定蛋白,样本量要求相对灵活,具体请咨询技术团队。

详细送样指南请参考 送样准备。

Aimsmass送样准备示意图

常见问题

位点鉴定和蛋白质组学有什么区别?

位点鉴定针对已知的特定目标蛋白,精准定位修饰发生在哪个氨基酸残基上,适用于已有明确研究目标、需要验证或深入分析某个蛋白修饰位点的场景。蛋白质组学则在全蛋白水平进行全局性修饰分析,无需预设目标,适合探索性研究和发现新的修饰位点。简单来说:已知蛋白选位点鉴定,探索未知选蛋白质组学。两者可配合使用——先通过组学发现候选位点,再用位点鉴定进行靶向验证。

一次实验可以同时检测多种修饰吗?

可以。Aimsmass 支持一次实验同时分析最多 3 种修饰类型,只需知道具体修饰基团的分子量即可进行研究。实验前准备简单,标准周期约一周。

送样要求是什么?

常规动物组织 100mg,软体动物组织 1g,常规植物组织 1g,植物果实及种子 2g-4g,细胞样本 2×107 个,菌类样本 150mg,最低蛋白质量 1mg。位点鉴定因针对特定蛋白,样本量要求相对灵活,具体可咨询技术团队。

项目周期多长?交付哪些内容?

标准交付周期约 1 周,从样本接收到数据报告交付。交付内容包括:原始质谱数据(.raw)、搜库结果(肽段列表与修饰位点定位)、修饰位点汇总表格、以及关键谱图。如需生信下游分析可另行沟通。

数据质量如何保证?

采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统。搜库软件使用 MaxQuant 或 Proteome Discoverer,修饰位点定位置信度(localization probability)≥ 0.75 方纳入报告。

相关蛋白质组学服务

如需在全蛋白水平进行系统性修饰分析,可参考以下蛋白质组学服务:

已有目标蛋白?定制靶向位点鉴定方案

提交咨询,Aimsmass 技术团队将根据您的目标蛋白和研究目的,定制精准的修饰位点鉴定方案与报价。

获取位点鉴定方案与报价

电话:021-51914748 | 邮箱:info@aimsmass.cn