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AIMS 专业服务

乳酸化蛋白质组学

基于 LC-MS/MS 高通量质谱平台,系统性绘制生物样本中的乳酸化修饰景观图谱,揭示蛋白质翻译后修饰调控网络。

Thermo Fisher 高分辨质谱 LC-MS/MS 全局分析 系统性修饰景观图谱
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乳酸化概述

赖氨酸的乳酸化是通过改变葡萄糖代谢动力学和乳酸水平来调节的。消耗乳酸产生的糖酵解抑制剂会降低赖氨酸的乳酸化,而线粒体抑制剂或缺氧会增加乳酸产生,从而增加赖氨酸的乳酸化。这些发现建立了一种新的组蛋白修饰,可由乳酸盐特异性调节[1]。

在细胞生理学中,不同的组蛋白修饰对调控靶基因的转录过程具有重要意义。一些赖氨酸酰化修饰对糖酵解速率的变化有反应,包括组蛋白丁基化、组蛋白丙酰化和组蛋白 2-羟基异丁基化。组蛋白乳酸化的发现为糖代谢在独立于乙酰辅酶 A 的组蛋白修饰调节中的作用提供了新的认识[2]。

蛋白乳酸化修饰的组蛋白调控与 Warburg 效应示意图

乳酸化蛋白质组学的研究价值

乳酸化(Lactylation)是 2019 年由芝加哥大学赵英明教授团队发现的一种新型翻译后修饰,由乳酸(Lactate)作为酰基供体,将乳酰基团共价连接到蛋白质赖氨酸残基上。作为糖酵解代谢的终产物,乳酸通过乳酸化修饰直接调控组蛋白和非组蛋白功能,建立了代谢与表观遗传之间的直接联系。[3]

乳酸化蛋白质组学在肿瘤微环境研究中尤为重要:肿瘤细胞的 Warburg 效应导致大量乳酸产生,乳酸化修饰广泛影响肿瘤相关巨噬细胞极化、免疫逃逸和基因表达重编程。系统性鉴定乳酸化位点为揭示"代谢-表观遗传"调控轴提供了关键分子信息。[4]

N 肿瘤微环境与免疫逃逸

肿瘤微环境中高浓度乳酸通过乳酸化修饰促进 M2 型巨噬细胞极化,抑制 T 细胞功能,构建免疫抑制微环境。乳酸化蛋白质组学可系统性揭示肿瘤代谢驱动的免疫逃逸机制。[4]

I 表观遗传与基因调控

组蛋白乳酸化(如 H3K18la、H4K12la)作为新型表观遗传标记激活基因转录,在巨噬细胞 M2 极化相关基因启动子区富集。该发现为 Warburg 效应的表观遗传学解释提供了直接证据。

C 炎症消退与组织修复

乳酸化修饰在炎症晚期促进巨噬细胞从促炎(M1)向抗炎(M2)表型转化,参与炎症消退和组织修复过程。该机制为理解炎症的自限性和慢性炎症疾病提供了新视角。

Aimsmass 技术方案

Aimsmass 基于专业的 LC-MS/MS 质谱平台,提供乳酸化蛋白质组学服务,可对生物样本进行全局乳酸化修饰定性分析。

乳酸化修饰富集与质谱鉴定

采用乳酸化特异性抗体(如 anti-Kla)进行免疫亲和富集,将乳酸化修饰肽段从复杂样品中高效分离。富集后的肽段经高分辨 LC-MS/MS 分析,结合可变修饰搜库策略(+72.021 Da),系统性鉴定乳酸化位点。

乳酸化蛋白质组学定量策略对比

在全局鉴定乳酸化修饰位点的基础上,定量分析可进一步比较不同生理/病理状态下修饰水平的动态变化。Aimsmass 提供多种定量策略供选择:

对比维度Label-free 非标记定量iTRAQ/TMT 标记定量DIA 数据非依赖采集
样本通量无限制,灵活多样最多 16 个样本同时标记无限制,适合大队列
定量精度中等,需较多技术重复高,多通道内标校正高,谱图库辅助定量
成本最低,无试剂费用较高,需标记试剂中等
适用场景样本量大、预算有限的探索性研究精确比较少量样本间的修饰差异大队列临床样本、时间序列研究
推荐Aimsmass 技术团队会根据您的实验设计和样本数量推荐最优定量方案
选择方法 & 咨询报价 或拨打 021-51914748

数据交付内容

修饰位点鉴定列表

包含修饰蛋白名称、修饰位点位置、修饰肽段序列、鉴定置信度评分(FDR 控制)。

原始质谱数据

提供全部 LC-MS/MS 原始数据文件(.raw/.mzML),支持后续独立数据分析与验证。

搜库结果与质控报告

数据库搜索结果(含搜库参数说明)、质控指标汇总(肽段/蛋白 FDR、鉴定数量统计)。

增值分析(可选)

差异修饰定量分析、GO 功能注释、KEGG 通路富集、蛋白互作网络分析等生信分析报告。

Thermo
高分辨质谱平台
4-6
周常规服务周期
1%
肽段级 FDR 控制
LC-MS/MS
高通量检测

送样要求

样本类型送样量/每个样本
常规动物组织100mg
软体动物组织1g
常规植物组织1g
植物果实及种子2g-4g
细胞样本2×107
菌类样本150mg
最低蛋白质量:1mg

* 具体的样本制备和保存要求请参考送样指南,或联系技术支持获取定制化送样方案。

检测平台:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统 + HPLC-MS/MS

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电话:021-51914748  |  邮箱:info@aimsmass.cn  |  或联系 在线客服

相关蛋白质组学服务

  1. Xie Y, Hu H, Liu M, Zhou T, Cheng X, Huang W, Cao L. The role and mechanism of histone lactylation in health and diseases. Front Genet. 2022;13:949252. DOI:10.3389/fgene.2022.949252 乳酸化
  2. Wan J, Liu H, Chu J, Zhang H. Functions and mechanisms of lysine crotonylation. J Cell Mol Med. 2019;23(11):7163-7169. DOI:10.1111/jcmm.14650 酰基化
  3. Xu Y, Shi Z, Bao L. An Expanding Repertoire of Protein Acylations. Mol Cell Proteomics. 2022;21(3):100193. DOI:10.1016/j.mcpro.2022.100193 综述

常见问题

乳酸化蛋白质组学服务有什么优势?

操作容易简单,不需同位素标记,实验流程简单。高精度与准确性,可全局绘制修饰景观图谱,采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统,获取更多肽段信息,找到更多修饰位点。检测范围广,可系统性绘制各种细胞或组织中乳酸化修饰景观图谱。

样本送样要求是什么?

常规动物组织 100mg,软体动物组织 1g,常规植物组织 1g,植物果实及种子 2g-4g,细胞样本 2×107 个,菌类样本 150mg,最低蛋白质量 1mg。具体的样本制备和保存要求请参考送样指南。

乳酸化蛋白质组学服务周期一般多长?

常规服务周期为 4-6 周,包含样本前处理、修饰富集、LC-MS/MS 检测和数据分析全流程。如样本量较大或有特殊需求(如多组学联用),周期可能适当延长。具体时间安排可在咨询时与 Aimsmass 技术团队确认。

交付的数据包含哪些内容?

标准交付内容包括:乳酸化修饰位点鉴定列表(含修饰蛋白名称、位点位置、肽段序列、FDR 评分)、LC-MS/MS 原始数据文件(.raw/.mzML)、搜库结果与质控报告(含搜库参数和鉴定统计)。可选增值服务包括差异修饰定量分析、GO 功能注释、KEGG 通路富集等生信分析报告。

组学发现后如何验证目标乳酸化位点?

Aimsmass 提供配套的乳酸化位点鉴定技术服务和验证试剂盒,可通过 Western Blot、定点突变和功能实验对组学发现的目标位点进行独立验证,形成"组学发现 → 靶向验证"的完整研究闭环。

一次实验能鉴定多少乳酸化修饰位点?

鉴定数量取决于样本类型、蛋白复杂度和修饰丰度。一般情况下,单次实验可鉴定数百至数千个乳酸化修饰位点。采用高深度分级分离策略可进一步提高鉴定覆盖度。Aimsmass 技术团队会根据研究目标推荐最优方案。

服务咨询


选择修饰类型,最多 3 种;费用因修饰不同而异

也可直接拨打 021-51914748 或发送邮件至 info@aimsmass.cn