乙酰化概述
乙酰化修饰与蛋白活性调控紧密相关；大部分研究发现非组蛋白乙酰化发生在赖氨酸残基，这种修饰对于影响 mRNA 稳定、蛋白定位、相互作用以及降解过程扮演重要角色。更有趣的是，这些非组蛋白乙酰化与肿瘤发生、癌细胞增殖、免疫效应还有关[1]。
赖氨酸（Lysine）乙酰化修饰是一个可逆的过程，而且是转录相关过程中染色质蛋白的重要修饰，通过乙酰化修饰影响蛋白之间相互作用和蛋白与 DNA 的相互作用。除组蛋白修饰之外，还有很多非组蛋白的赖氨酸残基发生乙酰化。赖氨酸乙酰化修饰异常可能引起各种疾病，包括癌症、糖尿病、心血管疾病以及神经退行性疾病等。当然赖氨酸残基不仅可以发生乙酰化修饰，还可以发生甲基化、泛素化和 SUMO 化修饰[2]。
乙酰化蛋白质组学的研究价值
蛋白质乙酰化是最早被发现的组蛋白翻译后修饰之一，由组蛋白乙酰转移酶（HAT/KAT）催化将乙酰辅酶 A 的乙酰基团转移到赖氨酸 ε-氨基上，由组蛋白去乙酰化酶（HDAC/KDAC）催化去除。乙酰化修饰通过中和赖氨酸正电荷松弛染色质结构，促进转录因子结合和基因激活。[3]
乙酰化蛋白质组学研究表明，乙酰化修饰广泛存在于非组蛋白中，包括代谢酶、细胞骨架蛋白和信号分子等，揭示了乙酰化在代谢调控、细胞骨架重塑和信号转导中的广泛作用。基于 LC-MS/MS 的全局乙酰化分析为理解"乙酰化组（Acetylome）"的功能网络提供了系统性工具。[4]
表观遗传与转录调控
组蛋白乙酰化（如 H3K27ac、H3K9ac）是活性增强子和转录起始位点的标志性表观遗传标记。乙酰化蛋白质组学结合 ChIP-seq 可全面揭示乙酰化修饰对基因表达程序的调控。
代谢调控
线粒体代谢酶（如 ACLY、IDH2）和细胞质代谢相关蛋白的乙酰化修饰调控酶活性和代谢通量。乙酰化修饰将代谢状态（乙酰辅酶 A 水平）与蛋白功能直接联系起来，是代谢研究的重要方向。
肿瘤与 HDAC 抑制剂
HDAC 抑制剂（如伏立诺他、罗米地辛）已被批准用于 T 细胞淋巴瘤治疗。乙酰化蛋白质组学可评估 HDAC 抑制剂的底物谱和脱靶效应，为联合用药和新适应症开发提供依据。
Aimsmass 技术方案
Aimsmass 基于专业的 LC-MS/MS 质谱平台，提供乙酰化蛋白质组学服务，可对细胞、组织及其他生物样本进行全局乙酰化修饰定性分析。
乙酰化修饰富集与质谱鉴定
采用乙酰化赖氨酸特异性抗体（anti-AcK）进行免疫亲和富集，将乙酰化修饰肽段从复杂样品中高效分离。富集后的肽段经高分辨 LC-MS/MS 分析，可系统性鉴定组蛋白和非组蛋白的乙酰化位点。
乙酰化蛋白质组学定量策略对比
在全局鉴定乙酰化修饰位点的基础上，定量分析可进一步比较不同生理/病理状态下修饰水平的动态变化。Aimsmass 提供多种定量策略供选择：
| 对比维度 | Label-free 非标记定量 | iTRAQ/TMT 标记定量 | DIA 数据非依赖采集 |
|---|---|---|---|
| 样本通量 | 无限制，灵活多样 | 最多 16 个样本同时标记 | 无限制，适合大队列 |
| 定量精度 | 中等，需较多技术重复 | 高，多通道内标校正 | 高，谱图库辅助定量 |
| 成本 | 最低，无试剂费用 | 较高，需标记试剂 | 中等 |
| 适用场景 | 样本量大、预算有限的探索性研究 | 精确比较少量样本间的修饰差异 | 大队列临床样本、时间序列研究 |
| 推荐 | Aimsmass 技术团队会根据您的实验设计和样本数量推荐最优定量方案 | ||
数据交付内容
修饰位点鉴定列表
包含修饰蛋白名称、修饰位点位置、修饰肽段序列、鉴定置信度评分（FDR 控制）。
原始质谱数据
提供全部 LC-MS/MS 原始数据文件（.raw/.mzML），支持后续独立数据分析与验证。
搜库结果与质控报告
数据库搜索结果（含搜库参数说明）、质控指标汇总（肽段/蛋白 FDR、鉴定数量统计）。
增值分析（可选）
差异修饰定量分析、GO 功能注释、KEGG 通路富集、蛋白互作网络分析等生信分析报告。
送样要求
| 样本类型 | 送样量/每个样本 |
|---|---|
| 常规动物组织 | 100mg |
| 软体动物组织 | 1g |
| 常规植物组织 | 1g |
| 植物果实及种子 | 2g-4g |
| 细胞样本 | 2×107 |
| 菌类样本 | 150mg |
| 最低蛋白质量：1mg | |
* 具体的样本制备和保存要求请参考送样指南，或联系技术支持获取定制化送样方案。
检测平台：Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪（分辨率 240,000 @ m/z 200，扫描速度 40 Hz），搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统 + HPLC-MS/MS
如需对特定蛋白的乙酰化修饰位点进行靶向鉴定和验证，可参考 乙酰化位点鉴定技术服务。
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获取定制方案与报价相关蛋白质组学服务
- Ali I, et al. Lysine Acetylation Goes Global: From Epigenetics to Metabolism and Therapeutics. Chem Rev. 2018;118(3):1216-1252. DOI:10.1021/acs.chemrev.7b00181 乙酰化
- Zhang K, et al. Protein lysine acetylation analysis: current MS-based proteomic technologies. Analyst. 2013;138(6):1628-1636. DOI:10.1039/c3an36837h 方法学
- Rizo J, et al. Bacterial protein acetylation: mechanisms, functions, and methods for study. Front Cell Infect Microbiol. 2024;14:1408947. DOI:10.3389/fcimb.2024.1408947 技术进展
常见问题
乙酰化蛋白质组学服务有什么优势？
操作容易简单，不需同位素标记，实验流程简单。高精度与准确性，可全局绘制修饰景观图谱，采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪（分辨率 240,000 @ m/z 200，扫描速度 40 Hz），搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统，获取更多肽段信息，找到更多修饰位点。检测范围广，可系统性绘制各种细胞或组织中乙酰化修饰景观图谱。
样本送样要求是什么？
常规动物组织 100mg，软体动物组织 1g，常规植物组织 1g，植物果实及种子 2g-4g，细胞样本 2×107 个，菌类样本 150mg，最低蛋白质量 1mg。具体的样本制备和保存要求请参考送样指南。
乙酰化蛋白质组学服务周期一般多长？
常规服务周期为 4-6 周，包含样本前处理、修饰富集、LC-MS/MS 检测和数据分析全流程。如样本量较大或有特殊需求（如多组学联用），周期可能适当延长。具体时间安排可在咨询时与 Aimsmass 技术团队确认。
交付的数据包含哪些内容？
标准交付内容包括：乙酰化修饰位点鉴定列表（含修饰蛋白名称、位点位置、肽段序列、FDR 评分）、LC-MS/MS 原始数据文件（.raw/.mzML）、搜库结果与质控报告（含搜库参数和鉴定统计）。可选增值服务包括差异修饰定量分析、GO 功能注释、KEGG 通路富集等生信分析报告。
组学发现后如何验证目标乙酰化位点？
Aimsmass 提供配套的乙酰化位点鉴定技术服务和验证试剂盒，可通过 Western Blot、定点突变和功能实验对组学发现的目标位点进行独立验证，形成"组学发现 → 靶向验证"的完整研究闭环。
一次实验能鉴定多少乙酰化修饰位点？
鉴定数量取决于样本类型、蛋白复杂度和修饰丰度。一般情况下，单次实验可鉴定数百至数千个乙酰化修饰位点。采用高深度分级分离策略可进一步提高鉴定覆盖度。Aimsmass 技术团队会根据研究目标推荐最优方案。