针对特定目标蛋白,精准定位 N-乙酰化和赖氨酸乙酰化修饰发生的精确氨基酸残基。Aimsmass 基于免疫亲和富集与高分辨 LC-MS/MS 平台,从肽段水平确认乙酰化位点,为表观遗传调控和蛋白功能研究提供分子水平的确切证据。
乙酰化修饰与蛋白活性调控紧密相关。大部分研究发现非组蛋白乙酰化发生在赖氨酸残基,这种修饰影响 mRNA 稳定性、蛋白定位、相互作用以及降解过程。这些非组蛋白乙酰化与肿瘤发生、癌细胞增殖、免疫效应密切相关。
乙酰化修饰主要分为两类:N-乙酰化(发生在蛋白 N 端)和赖氨酸乙酰化(发生在 Lys 残基的 ε-氨基上)。N-乙酰化是真核生物蛋白中最常见的修饰,约 85% 的哺乳动物蛋白和 60% 的酵母蛋白存在此修饰。赖氨酸乙酰化是一个可逆过程,在组蛋白和非组蛋白中均广泛存在,由乙酰基转移酶(HAT/KAT)催化、去乙酰化酶(HDAC/KDAC)去除。
乙酰化位点鉴定的核心目标是:在已知的特定蛋白上,精确鉴定乙酰化发生在哪一个氨基酸残基上,从而为后续的功能验证和机制研究提供分子水平的确凿证据。
蛋白乙酰化主要分为两大类,在连接位点和生物学功能上各有不同:
连接位点:蛋白 N 端氨基酸残基
常见底物:丝氨酸、丙氨酸、苏氨酸的 N 端残基
结构特征:共翻译修饰,由 N-乙酰转移酶(NAT)催化,不可逆
生物学功能:影响蛋白稳定性、亚细胞定位和蛋白-蛋白相互作用
典型蛋白:组蛋白 H4、β-淀粉样前体蛋白
连接位点:赖氨酸(Lys)残基的 ε-氨基
催化酶:乙酰基转移酶(HAT/KAT)
去修饰酶:去乙酰化酶(HDAC/KDAC/Sirtuin)
生物学功能:调控染色质结构、基因转录、蛋白互作及代谢调控
典型蛋白:组蛋白 H3/H4、p53、NF-κB、α-tubulin
乙酰化位点鉴定针对特定目标蛋白,通过免疫亲和富集乙酰化肽段后进行 LC-MS/MS 分析,精确定位修饰位点。标准流程如下:
针对已知目标蛋白进行定向乙酰化分析,结果精确到具体氨基酸残基,直接服务于功能验证研究。
一次实验同时检测 N-乙酰化和赖氨酸乙酰化位点,全面覆盖两种主要乙酰化类型。
可选乙酰化肽段免疫亲和富集,显著提高低丰度乙酰化位点的检测覆盖率。
采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统,确保乙酰化肽段检测的灵敏度和位点定位精度。
常规动物组织:100mg
软体动物组织:1g
常规植物组织:1g
植物果实及种子:2g-4g
细胞样本:2×107
菌类样本:150mg
最低蛋白质量:1mg
检测平台:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统
位点鉴定因针对特定蛋白,样本量要求相对灵活,支持血清、重组蛋白等特殊样本,具体请咨询技术团队。
详细送样指南请参考 送样准备。
位点鉴定针对已知的特定目标蛋白,精准定位乙酰化发生在哪个氨基酸残基上,适用于已有明确研究目标的场景。蛋白质组学则在全蛋白水平进行系统性乙酰化分析,无需预设目标,适合探索性研究。简单来说:已知目标蛋白选位点鉴定,探索未知选蛋白质组学。
N-乙酰化发生在蛋白 N 端,是共翻译修饰,通常不可逆,约 85% 哺乳动物蛋白存在此修饰。赖氨酸乙酰化发生在 Lys 残基的 ε-氨基上,是可逆修饰,由 HAT/KAT 催化、HDAC 去除,在表观遗传调控中起核心作用。两者的分析策略不同,Aimsmass 可在一次实验中同步覆盖。
常规动物组织 100mg,细胞样本 2×107 个,菌类样本 150mg,最低蛋白质量 1mg。位点鉴定因针对特定蛋白,样本量要求相对灵活,支持 SDS-PAGE 胶条和蛋白溶液样本。
标准交付周期约 1-2 周。交付内容包括:原始质谱数据(.raw)、乙酰化位点定位结果表(含位点置信度)、修饰肽段序列信息、关键质谱谱图。如需生信下游分析可另行沟通。
采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统。乙酰化修饰质量偏移为 +42.0106 Da(赖氨酸),通过高分辨 MS/MS 谱图确认修饰位点,位点定位置信度(localization probability)≥ 0.75。
如需在全蛋白水平进行系统性乙酰化分析,或对其他修饰类型进行研究,可参考以下服务:
提交咨询,Aimsmass 技术团队将根据您的目标蛋白和研究目的,定制精准的乙酰化位点鉴定方案与报价。
获取位点鉴定方案与报价电话:021-51914748 | 邮箱:info@aimsmass.cn