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AIMS 专业服务

SUMO化位点鉴定

针对特定目标蛋白,精准定位 SUMO(Small Ubiquitin-like Modifier)修饰发生的精确赖氨酸残基。Aimsmass 基于 SUMO remnant 策略与高分辨 LC-MS/MS 平台,覆盖 SUMO1/2/3 亚型,为转录调控和蛋白功能研究提供分子水平的确切证据。

SUMO1/2/3亚型覆盖
~11 kDaSUMO 修饰分子量
~1-2 周标准交付周期
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本页面是SUMO化「位点鉴定」服务入口。如果您已有明确的目标蛋白,需要精确定位其上的SUMO化修饰位点,请在此选择对应服务。如需在全蛋白水平进行系统性SUMO化分析,请访问 SUMO化蛋白质组学。

SUMO化是一种可逆的蛋白翻译后修饰,发生在蛋白的赖氨酸残基上,连接约 11 kDa 的 SUMO(Small Ubiquitin-like Modifier)小肽。与泛素化类似,SUMO化也需要 E1(SAE1/SAE2)、E2(Ubc9)和 E3 连接酶的级联反应协助完成。

SUMO化修饰参与多种蛋白功能调控:使蛋白单体聚合或分离、切换蛋白间互作关系、调控蛋白与 DNA 的结合。哺乳动物有四种 SUMO 亚型(SUMO1-4),其中 SUMO1 主要参与组成型修饰,SUMO2/3 在应激条件下大量表达。SUMO化修饰还与心血管疾病、癌症、神经退行性疾病和免疫疾病的发生发展密切相关。

SUMO化位点鉴定的核心目标是:在已知的特定蛋白上,精确鉴定 SUMO 修饰发生在哪一个赖氨酸残基上,并区分 SUMO 亚型。

SUMO 亚型

哺乳动物有四种 SUMO 亚型,在表达模式和功能上各有不同:

SUMO1

表达模式:组成型表达,在正常生理条件下参与蛋白修饰

功能特点:主要参与蛋白-蛋白互作调控、核质运输、转录调控

remnant 质量:酶切后保留特定 di-Gly remnant

典型底物:RanGAP1、PML、p53、IκBα

组成型核质运输转录调控

SUMO2/3

表达模式:应激诱导型,在热休克、氧化应激等条件下大量表达

功能特点:参与应激反应、DNA 损伤修复、蛋白质量控制

链形成:SUMO2/3 可形成多聚链(SUMO1 通常不形成链)

典型底物:拓扑异构酶、DNA 修复蛋白、染色质调节因子

应激诱导DNA 修复多聚链

技术方案

SUMO化位点鉴定利用 SUMO remnant 策略:胰蛋白酶酶切后,SUMO 修饰的赖氨酸残基上保留特征性 remnant,通过免疫亲和富集后进行 LC-MS/MS 分析。标准流程如下:

蛋白提取目标蛋白纯化/SDS-PAGE 分离
→
酶切消化胰蛋白酶酶解(保留 SUMO remnant)
→
肽段富集SUMO 修饰肽段免疫亲和富集
→
LC-MS/MS高分辨质谱采集
→
位点定位SUMO化位点确认
SUMO化修饰酶级联反应与功能调控示意图 SUMO化修饰对蛋白-DNA 互作的影响 SUMO化修饰与人类疾病的关联

服务优势

  • SUMO 亚型区分

    可区分 SUMO1 和 SUMO2/3 修饰,通过不同 remnant 质量偏移鉴定亚型。

  • 靶向精准

    针对已知目标蛋白进行定向分析,结果精确到具体赖氨酸残基。

  • 覆盖度高

    可选 SUMO 修饰肽段免疫亲和富集,提高低丰度修饰位点的检测覆盖率。

  • 高分辨质谱平台

    采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统,确保 SUMO remnant 检测的灵敏度和位点定位精度。

送样要求

常规动物组织:100mg

软体动物组织:1g

常规植物组织:1g

植物果实及种子:2g-4g

细胞样本:2×107

菌类样本:150mg

最低蛋白质量:1mg

检测平台:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统

位点鉴定因针对特定蛋白,样本量要求相对灵活,支持血清、重组蛋白等特殊样本,具体请咨询技术团队。

详细送样指南请参考 送样准备。

Aimsmass送样准备示意图

常见问题

SUMO化位点鉴定和 SUMO化蛋白质组学有什么区别?

位点鉴定针对已知的特定目标蛋白,精准定位 SUMO 修饰发生在哪个赖氨酸残基上,并可区分 SUMO 亚型。蛋白质组学则在全蛋白水平进行系统性 SUMO化分析,适合发现新的 SUMO 底物。已知目标蛋白选位点鉴定,探索未知选蛋白质组学。

SUMO化和泛素化有什么区别?

SUMO 和泛素都是小蛋白修饰,但功能截然不同。泛素化主要介导蛋白酶体降解(K48 链),SUMO化则参与转录调控、核质运输和蛋白互作切换,通常不导致蛋白降解。两者的 remnant 质量偏移不同,质谱可区分。

送样要求是什么?

常规动物组织 100mg,细胞样本 2×107 个,最低蛋白质量 1mg。支持 SDS-PAGE 胶条和蛋白溶液样本。SUMO化修饰丰度较低,建议提供足量样本。

如何区分 SUMO1 和 SUMO2/3 修饰?

SUMO1 和 SUMO2/3 的氨基酸序列不同,胰蛋白酶酶切后产生的 remnant 肽段质量不同。通过高分辨质谱可精确区分。SUMO2 和 SUMO3 序列高度相似,通常合并为 SUMO2/3 进行分析。

项目周期多长?

标准交付周期约 1-2 周。交付内容包括:原始质谱数据、SUMO化位点定位结果表(含 SUMO 亚型信息)、修饰肽段序列、关键质谱谱图。

相关服务

如需在全蛋白水平进行系统性SUMO化分析,或对其他修饰类型进行研究,可参考以下服务:

已有目标蛋白?定制SUMO化位点鉴定方案

提交咨询,Aimsmass 技术团队将根据您的目标蛋白和研究目的,定制精准的SUMO化位点鉴定方案与报价。

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电话:021-51914748 | 邮箱:info@aimsmass.cn