蛋白质组学服务（Proteomics）是在全蛋白水平对翻译后修饰进行系统性、无偏倚分析的实验策略。与针对单一目标蛋白的位点鉴定不同，组学服务一次实验即可鉴定数千个修饰位点，绘制完整的修饰景观图谱，帮助研究者发现新的修饰事件、揭示修饰调控网络、筛选候选生物标志物。
Aimsmass 基于 Thermo Fisher 高分辨质谱平台，已建立覆盖 24 种修饰类型的蛋白质组学服务体系，按技术路线分为半胱氨酸修饰（6 种）、化学蛋白质修饰（7 种）和抗体富集（11 种）三大类。本页汇总全部 24 种修饰的组学服务入口，方便您快速定位所需的分析方案。
何时该选择蛋白质组学？
蛋白质组学与位点鉴定是互补的两类服务。以下流程可帮助您快速判断应选择哪种方案：
Q1: 您是否已有明确的目标蛋白需要验证修饰？
→ 是 — 建议选择位点鉴定服务，针对特定蛋白进行靶向修饰验证。前往 位点鉴定目录页 查看 24 种修饰的鉴定服务。
→ 否，想发现新修饰或了解全局修饰状况 — 继续往下看。
Q2: 您是否关注某一种特定的修饰类型？
→ 是 — 直接在下方列表中选择对应修饰的组学服务页面，了解具体的实验方案、样本要求和交付内容。
→ 否，想全面摸底所有修饰类型 — 建议 联系我们定制联合方案，可根据课题需求设计多修饰联合分析。
24 种修饰蛋白质组学服务
以下按技术路线分为三大类，每种修饰均提供全蛋白水平的修饰景观分析服务。如某项研究需要对特定蛋白进行靶向验证，可跳转至对应的位点鉴定服务。
一、半胱氨酸修饰蛋白质组学（6 种）
以半胱氨酸残基为修饰位点的一类翻译后修饰，涉及氧化还原信号、脂质锚定、蛋白折叠等关键生物学过程。技术路线以点击化学（Click Chemistry）和 ABE（Acyl-Biotin Exchange）为主。
全蛋白水平棕榈酰化修饰景观分析，揭示蛋白脂质锚定与膜定位调控网络。
全蛋白水平亚硝基化修饰景观分析，解析 NO 信号通路与氧化还原调控。
全蛋白水平谷胱甘肽化修饰景观分析，探索氧化应激下的蛋白保护与调控机制。
全蛋白水平二硫键修饰景观分析，研究蛋白高级结构维持与亚基组装。
全蛋白水平亚磺酸化修饰景观分析，揭示活性氧信号中的可逆氧化修饰网络。
全蛋白水平过硫化修饰景观分析，研究 H₂S 信号通路与半胱氨酸过硫化调控。
二、化学蛋白质修饰组学（7 种）
基于化学反应原理的蛋白修饰鉴定，涵盖脂质修饰、小分子共价修饰及新型非酶促修饰。技术路线以化学反应标记结合 LC-MS/MS 为主。
全蛋白水平异戊烯化修饰景观分析，研究 Ras 等信号蛋白膜定位与脂质锚定调控。
全蛋白水平瓜氨酸化修饰景观分析，解析 PAD 酶催化的精氨酸脱亚胺修饰网络。
全蛋白水平衣康酸化修饰景观分析，探索免疫代谢中的新型半胱氨酸修饰。
全蛋白水平豆蔻酰化修饰景观分析，研究蛋白 N 端脂质锚定修饰与信号传导。
全蛋白水平多巴胺修饰景观分析，揭示神经递质相关蛋白共价修饰网络。
全蛋白水平同型半胱氨酸化修饰景观分析，研究心血管风险因子相关的蛋白修饰。
全蛋白水平血清素化修饰景观分析，探索转酰胺酶催化的新型单胺修饰。
三、抗体富集蛋白质组学（11 种）
利用修饰特异性抗体进行免疫亲和富集，结合 LC-MS/MS 实现高通量修饰组学分析。是目前磷酸化、泛素化、乙酰化等经典修饰最成熟的组学技术路线。
全蛋白水平乳酸化修饰景观分析，研究代谢调控的新型赖氨酸酰化修饰。
全蛋白水平磷酸化修饰景观分析，绘制激酶信号网络与蛋白磷酸化全景图。
全蛋白水平 SUMO 化修饰景观分析，研究亚细胞定位与蛋白相互作用调控。
全蛋白水平泛素化修饰景观分析，揭示蛋白降解标记与信号调控网络。
全蛋白水平乙酰化修饰景观分析，解析表观遗传与转录调控的修饰全景。
全蛋白水平甲基化修饰景观分析，研究蛋白构象变化与蛋白-蛋白相互作用调控。
全蛋白水平羟基化修饰景观分析，研究脯氨酸/赖氨酸羟化与胶原代谢调控。
全蛋白水平琥珀酰化修饰景观分析，揭示三羧酸循环代谢物驱动的新型修饰。
全蛋白水平巴豆酰化修饰景观分析，研究组蛋白新型酰化修饰与转录调控。
全蛋白水平 3-羟基丁酰化修饰景观分析，探索酮体代谢驱动的表观遗传修饰。
全蛋白水平赖氨酸丙酰化修饰景观分析，研究新型赖氨酸酰化修饰网络。
技术平台与路线
Aimsmass 蛋白质组学服务基于以下核心平台与技术：
- 质谱平台：Thermo Fisher 高分辨质谱仪（Orbitrap 系列），搭配 nanoLC 液相色谱系统，实现高灵敏度、高分辨率的修饰肽段鉴定与定量。
- 半胱氨酸修饰富集：点击化学（Click Chemistry）标记生物素探针后亲和纯化；ABE（Acyl-Biotin Exchange）技术用于棕榈酰化等脂酰修饰的可逆标记富集。
- 抗体富集：修饰特异性抗体免疫亲和沉淀（如 anti-pSer/pThr/pTyr 磷酸化抗体、anti-diGly 泛素化抗体、anti-acetyl-Lys 乙酰化抗体等），结合 TMT/iTRAQ 标记或 Label-free 定量策略。
- 化学标记路线：基于化学反应的修饰标记与富集，适用于异戊烯化、衣康酸化、多巴胺修饰等新型修饰类型的组学分析。
- 定量策略：TMT（Tandem Mass Tag）多重标记定量，支持最多 16 个样本同时比较；iTRAQ 4/8 标定量；Label-free 无标记定量（DDA/DIA 采集模式）。
- 数据分析：MaxQuant / Proteome Discoverer 搜库鉴定，Perseus / R 语言统计分析，GO 注释、KEGG 通路富集、修饰 motif 分析、蛋白互作网络等生物信息学分析。
常见问题
蛋白质组学和位点鉴定有什么区别？
蛋白质组学服务在全蛋白水平进行系统性修饰分析，适合探索性研究、未知修饰发现和修饰全景绘制，一次实验可获得数千个修饰位点。位点鉴定服务针对已知的特定目标蛋白进行靶向修饰验证，适合已有明确候选蛋白的研究。两者可配合使用：先通过组学发现候选修饰位点，再用位点鉴定进行靶向验证。详见 位点鉴定目录页。
一次实验能做几种修饰？
蛋白质组学通常一次实验聚焦一种修饰类型，以保证鉴定深度和定量精度。部分修饰可联合分析（如磷酸化 + 泛素化），具体需根据修饰化学性质和富集策略确定。如需多修饰联合方案，建议咨询技术团队评估可行性。
样本要求是什么？
常规动物组织 100mg，软体动物组织 1g，常规植物组织 1g，植物果实及种子 2g-4g，细胞样本 2×107 个，菌类样本 150mg，最低蛋白质量 1mg。不同修饰类型的富集策略对样本量有不同要求，建议送样前咨询确认。详细送样指南请参考 送样准备。
如何拿到修饰位点数据？
交付内容包括：修饰位点鉴定列表（含蛋白名称、修饰位点、修饰肽段序列、置信度评分）、定量分析结果（TMT/iTRAQ 标记定量或 Label-free 定量）、生物信息学分析报告（GO 注释、KEGG 通路富集、修饰 motif 分析等）。所有数据以 Excel 表格和 PDF 报告形式交付。
相关服务
想做系统性修饰分析？不确定该选哪种组学方案？提交咨询获取定制方案，Aimsmass 技术团队将根据您的课题需求推荐最合适的实验路线。
