N-豆蔻酰化概述
肉豆蔻酰化是一种 14-碳的饱和脂肪酸(肉豆蔻酸)附着在真核蛋白质亚群的 N 端甘氨酸上的修饰。虽然经常被称为蛋白翻译后修饰 PTM,但它通常发生共翻译,当核糖体聚合不到 100 个残基时,并在去掉领头的蛋氨酸之后发生。催化肉豆蔻酸转移的酶是肉豆蔻酰基辅酶 A:N-肉豆蔻酰基转移酶(NMT)[1]。
肉豆蔻酰基的附着对于参与各种生物功能的蛋白质至关重要,包括信号转导、细胞定位和肿瘤发生。还有研究表明,蛋白质 N-肉豆蔻酰化参与宿主对微生物和病毒感染的防御。肉豆蔻酰化在信号转导、蛋白质稳定性和蛋白质在膜上的定位中起着重要作用[2]。
N-豆蔻酰化蛋白质组学的研究价值
N-豆蔻酰化是一种不可逆的脂质翻译后修饰,由 N-豆蔻酰转移酶(NMT)催化将 14 碳饱和脂肪酸(豆蔻酸)共价连接到蛋白质 N 端甘氨酸残基上。该修饰促进蛋白质的膜锚定和信号复合物组装,在细胞信号传导、病毒组装和凋亡调控中发挥关键作用。[3]
N-豆蔻酰化蛋白质组学通过系统性鉴定豆蔻酰化修饰蛋白,揭示 NMT 底物谱和脂质修饰调控网络。由于 NMT 在多种肿瘤和病毒感染中被劫持利用,豆蔻酰化蛋白质组学在抗肿瘤和抗病毒药物开发中具有重要应用价值。[4]
信号传导与膜定位
Src 家族激酶、G 蛋白 α 亚基和 ARF 家族蛋白等关键信号分子依赖 N-豆蔻酰化定位于细胞膜和内膜系统。豆蔻酰化蛋白质组学可系统性揭示脂质修饰调控的信号网络全貌。
感染与抗病毒研究
HIV-1 Gag、SARS-CoV-2 等多种病毒蛋白依赖宿主 NMT 进行豆蔻酰化修饰以实现病毒组装和释放。NMT 抑制剂作为广谱抗病毒药物的开发受到广泛关注。
凋亡信号与肿瘤
促凋亡蛋白 Bid 的豆蔻酰化促进其线粒体定位和细胞色素 c 释放,是凋亡信号传导的关键步骤。NMT1 在多种肿瘤中高表达,靶向 NMT 的抗肿瘤策略正在临床前研究中。
Aimsmass 技术方案
Aimsmass 基于专业的 LC-MS/MS 质谱平台,提供 N-豆蔻酰化蛋白质组学服务,可对生物样本进行全局豆蔻酰化修饰定性分析。
N-豆蔻酰化修饰鉴定与质谱分析
采用炔烃-豆蔻酸(Alk-Myr)代谢标记结合点击化学策略:细胞摄取炔烃标记的豆蔻酸类似物,经 NMT 催化整合到目标蛋白 N 端甘氨酸上,点击化学连接生物素标签后亲和富集,LC-MS/MS 鉴定 N-豆蔻酰化蛋白。
豆蔻酰化蛋白质组学定量策略对比
在全局鉴定豆蔻酰化修饰位点的基础上,定量分析可进一步比较不同生理/病理状态下修饰水平的动态变化。Aimsmass 提供多种定量策略供选择:
| 对比维度 | Label-free 非标记定量 | iTRAQ/TMT 标记定量 | DIA 数据非依赖采集 |
|---|---|---|---|
| 样本通量 | 无限制,灵活多样 | 最多 16 个样本同时标记 | 无限制,适合大队列 |
| 定量精度 | 中等,需较多技术重复 | 高,多通道内标校正 | 高,谱图库辅助定量 |
| 成本 | 最低,无试剂费用 | 较高,需标记试剂 | 中等 |
| 适用场景 | 样本量大、预算有限的探索性研究 | 精确比较少量样本间的修饰差异 | 大队列临床样本、时间序列研究 |
| 推荐 | Aimsmass 技术团队会根据您的实验设计和样本数量推荐最优定量方案 | ||
数据交付内容
修饰位点鉴定列表
包含修饰蛋白名称、修饰位点位置、修饰肽段序列、鉴定置信度评分(FDR 控制)。
原始质谱数据
提供全部 LC-MS/MS 原始数据文件(.raw/.mzML),支持后续独立数据分析与验证。
搜库结果与质控报告
数据库搜索结果(含搜库参数说明)、质控指标汇总(肽段/蛋白 FDR、鉴定数量统计)。
增值分析(可选)
差异修饰定量分析、GO 功能注释、KEGG 通路富集、蛋白互作网络分析等生信分析报告。
送样要求
| 样本类型 | 送样量/每个样本 |
|---|---|
| 常规动物组织 | 100mg |
| 软体动物组织 | 1g |
| 常规植物组织 | 1g |
| 植物果实及种子 | 2g-4g |
| 细胞样本 | 2×107 |
| 菌类样本 | 150mg |
| 最低蛋白质量:1mg | |
* 具体的样本制备和保存要求请参考送样指南,或联系技术支持获取定制化送样方案。
检测平台:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统 + HPLC-MS/MS
如需对特定蛋白的豆蔻酰化修饰位点进行靶向鉴定和验证,可参考 豆蔻酰化位点鉴定技术服务。
开启您的N-豆蔻酰化组学研究
提交咨询,Aimsmass 技术团队将根据您的课题定制实验方案和报价。
获取定制方案与报价 查看配套验证试剂盒相关蛋白质组学服务
- Tsumagari K, et al. Exploring protein lipidation by mass spectrometry-based proteomics. J Biochem. 2024;175(3):225-233. DOI:10.1093/jb/mvad109 异戊二烯化
- Storck EM, et al. Chemical proteomics: a powerful tool for exploring protein lipidation. Biochem Soc Trans. 2013;41(1):56-61. DOI:10.1042/bst20120283 豆蔻酰化
- Wang Y, Yang W. Proteome-Scale Analysis of Protein S-Acylation Comes of Age. J Proteome Res. 2020;20(1):14-26. DOI:10.1021/acs.jproteome.0c00409 综述
常见问题
N-豆蔻酰化蛋白质组学服务有什么优势?
操作容易简单,不需同位素标记,实验流程简单。高精度与准确性,可全局绘制修饰景观图谱,采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统,获取更多肽段信息,找到更多修饰位点。检测范围广,可系统性绘制各种细胞或组织中豆蔻酰化修饰景观图谱。
样本送样要求是什么?
常规动物组织 100mg,软体动物组织 1g,常规植物组织 1g,植物果实及种子 2g-4g,细胞样本 2×107 个,菌类样本 150mg,最低蛋白质量 1mg。具体的样本制备和保存要求请参考送样指南。
N-豆蔻酰化蛋白质组学服务周期一般多长?
常规服务周期为 4-6 周,包含样本前处理、修饰富集、LC-MS/MS 检测和数据分析全流程。如样本量较大或有特殊需求(如多组学联用),周期可能适当延长。具体时间安排可在咨询时与 Aimsmass 技术团队确认。
交付的数据包含哪些内容?
标准交付内容包括:N-豆蔻酰化修饰位点鉴定列表(含修饰蛋白名称、位点位置、肽段序列、FDR 评分)、LC-MS/MS 原始数据文件(.raw/.mzML)、搜库结果与质控报告(含搜库参数和鉴定统计)。可选增值服务包括差异修饰定量分析、GO 功能注释、KEGG 通路富集等生信分析报告。
组学发现后如何验证目标N-豆蔻酰化位点?
Aimsmass 提供配套的N-豆蔻酰化位点鉴定技术服务和验证试剂盒,可通过 Western Blot、定点突变和功能实验对组学发现的目标位点进行独立验证,形成"组学发现 → 靶向验证"的完整研究闭环。
一次实验能鉴定多少N-豆蔻酰化修饰位点?
鉴定数量取决于样本类型、蛋白复杂度和修饰丰度。一般情况下,单次实验可鉴定数百至数千个N-豆蔻酰化修饰位点。采用高深度分级分离策略可进一步提高鉴定覆盖度。Aimsmass 技术团队会根据研究目标推荐最优方案。
