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AIMS 专业服务

棕榈酰化位点鉴定

针对特定目标蛋白,精准定位 S-棕榈酰化修饰发生的精确半胱氨酸残基。Aimsmass 提供点击化学法和 ABE 生物素交换法两种技术路线,结合高分辨 LC-MS/MS 平台,为蛋白脂质化研究提供分子水平的确切证据。

2 种技术路线
~1-2 周标准交付周期
高分辨Orbitrap MS/MS
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本页面是棕榈酰化「位点鉴定」服务入口。如果您已有明确的目标蛋白,需要精确定位其上的棕榈酰化修饰位点,请在此选择对应服务。如需在全蛋白水平进行系统性棕榈酰化分析,请访问 S-棕榈酰化蛋白质组学。

棕榈酸(C16:0)是长链饱和脂肪酸,在细胞膜形成、信号传导和能量储存中扮演重要角色。S-棕榈酰化是指棕榈酰链通过硫酯键连接在蛋白的半胱氨酸残基上,这种修饰影响蛋白的定位和功能。与其他脂质修饰不同,蛋白棕榈酰化是高度动态的,棕榈酰化和去棕榈酰化循环调控着蛋白的功能和定位。

S-棕榈酰化是一种特殊的蛋白 S-酰基化,类似于磷酸化和乙酰化等可逆翻译后修饰。除了 S-酰基化,棕榈酸也可连接到氨基酸的氨基上形成 N-棕榈酰化,或在丝氨酸/苏氨酸的羟基上形成 O-棕榈酰化。伴随 S-棕榈酰化,还会有 N-豆蔻酰化和 S-异戊二烯化等其他脂质修饰同时发生。

棕榈酰化位点鉴定的核心目标是:在已知的特定蛋白上,精确鉴定棕榈酰化发生在哪一个半胱氨酸残基上,从而为蛋白膜定位和信号调控研究提供确凿证据。

点击化学法与 ABE 生物素交换法

Aimsmass 提供两种主流的棕榈酰化位点鉴定技术路线,可根据研究需求选择:

点击化学法(Click Chemistry)

原理:使用棕榈酸类似物(如 17-ODYA)进行代谢标记,再通过点击化学反应连接生物素标签

优势:标记效率高,背景低,可检测动态棕榈酰化/去棕榈酰化事件

适用场景:活细胞标记、动态棕榈酰化研究、新位点发现

关键试剂:17-ODYA / Alk-C16 + CuAAC 点击反应

代谢标记点击化学活细胞适用

ABE 生物素交换法

原理:先烷基化封闭自由巯基,再用羟胺特异性切断棕榈酰硫酯键,暴露的巯基与生物素反应

优势:无需代谢标记,适用于冻存样本和临床样本

适用场景:临床组织样本、已冻存样本、无法进行代谢标记的场景

关键步骤:NEM 封闭 → NH2OH 切断 → Biotin-HPDP 标记

无需标记冻存样本临床适用

技术方案

棕榈酰化位点鉴定通过特异性标记和富集棕榈酰化肽段后进行 LC-MS/MS 分析,精确定位修饰位点。两种技术路线的标准流程如下:

蛋白标记点击化学标记或 ABE 生物素交换
→
亲和富集链霉亲和素珠富集修饰肽段
→
酶切消化胰蛋白酶肽段制备
→
LC-MS/MS高分辨质谱采集
→
位点定位棕榈酰化位点确认
棕榈酸结构与蛋白棕榈酰化示意图 蛋白脂质化修饰类型对比:S-棕榈酰化、N-豆蔻酰化、S-异戊二烯化

点击化学法流程

点击化学法棕榈酰化位点鉴定流程
  • 代谢标记

    使用棕榈酸类似物(17-ODYA)标记目标蛋白

  • 点击反应

    催化反应促使修饰蛋白带上生物素标签

  • 亲和富集

    链霉亲和素珠富集修饰肽段

  • LC-MS/MS

    高分辨质谱检测修饰位点

ABE 生物素交换法流程

ABE 生物素交换法棕榈酰化位点鉴定流程
  • 巯基封闭

    NEM 烷基化封闭自由巯基

  • 去棕榈酰化

    羟胺(NH2OH)特异性切断棕榈酰硫酯键

  • 生物素标记

    Biotin-HPDP 与暴露的巯基反应

  • 亲和富集 + LC-MS/MS

    链霉亲和素富集后进行质谱检测

服务优势

  • 双技术路线覆盖

    提供点击化学和 ABE 两种方法,分别适用于活细胞动态标记和冻存/临床样本,满足不同研究需求。

  • 靶向精准

    针对已知目标蛋白进行定向棕榈酰化分析,结果精确到具体半胱氨酸残基。

  • 高灵敏度检测

    采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统,获取更多肽段信息,发现更多修饰位点。

  • 操作灵活

    无需放射性同位素标记,实验流程简单,支持多种样本类型。

送样要求

常规动物组织:100mg

软体动物组织:1g

常规植物组织:1g

植物果实及种子:2g-4g

细胞样本:2×107

菌类样本:150mg

最低蛋白质量:1mg

检测平台:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统

位点鉴定因针对特定蛋白,样本量要求相对灵活,支持血清、重组蛋白等特殊样本,具体请咨询技术团队。

详细送样指南请参考 送样准备。

Aimsmass送样准备示意图

常见问题

棕榈酰化位点鉴定和棕榈酰化蛋白质组学有什么区别?

位点鉴定针对已知的特定目标蛋白,精准定位棕榈酰化发生在哪个半胱氨酸残基上,适用于已有明确研究目标的场景。蛋白质组学则在全蛋白水平进行系统性棕榈酰化分析,无需预设目标,适合探索性研究。简单来说:已知目标蛋白选位点鉴定,探索未知选蛋白质组学。

点击化学法和 ABE 法应该如何选择?

点击化学法需要活细胞代谢标记,适合检测动态棕榈酰化事件和新位点发现,标记效率高。ABE 法无需代谢标记,适用于冻存样本和临床组织样本。如果您的样本是新鲜培养的细胞,推荐点击化学法;如果是冻存组织或临床样本,推荐 ABE 法。

送样要求是什么?

点击化学法需要提供新鲜培养的细胞(≥ 1×107),以便进行代谢标记。ABE 法可接受冻存组织(100mg)或细胞裂解液。两种方法均需设置未标记对照组。

项目周期多长?交付哪些内容?

标准交付周期约 1-2 周。交付内容包括:原始质谱数据(.raw)、棕榈酰化位点定位结果表、修饰肽段序列信息、关键质谱谱图。

数据质量如何保证?

采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统。棕榈酰化修饰(半胱氨酸)经标记后产生特征质量偏移,通过高分辨 MS/MS 谱图确认修饰位点。设置未标记对照排除假阳性。

相关服务

如需在全蛋白水平进行系统性棕榈酰化分析,或对其他修饰类型进行研究,可参考以下服务:

已有目标蛋白?定制棕榈酰化位点鉴定方案

提交咨询,Aimsmass 技术团队将根据您的目标蛋白和研究目的,定制精准的棕榈酰化位点鉴定方案与报价。

获取位点鉴定方案与报价

电话:021-51914748 | 邮箱:info@aimsmass.cn