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AIMS 专业服务

S-异戊烯化位点鉴定

针对特定目标蛋白,精准定位法尼基化(Farnesylation, 15-碳)和香叶酰化(Geranylgeranylation, 20-碳)修饰发生的精确半胱氨酸残基。Aimsmass 基于化学报告基团标记与高分辨 LC-MS/MS 平台,为 Ras/Rho/Rab 小 G 蛋白和膜信号研究提供分子水平的确切证据。

15C/20C法尼基/香叶酰
CaaX基序识别
~1-2 周标准交付周期
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本页面是S-异戊烯化「位点鉴定」服务入口。如果您已有明确的目标蛋白,需要精确定位其上的S-异戊烯化修饰位点,请在此选择对应服务。如需在全蛋白水平进行系统性S-异戊烯化分析,请访问 S-异戊烯化蛋白质组学。

S-异戊烯化是一种蛋白翻译后的脂质修饰,将法尼基(15-碳)或香叶基香叶基(20-碳)异戊二烯类脂链通过硫醚键连接到蛋白 C 末端或附近的半胱氨酸残基上。这种修饰赋予蛋白疏水性质,使其能够与细胞膜结合。

S-异戊烯化由两种酶催化:法尼基转移酶(FTase)以法尼基二磷酸(FPP)为底物,识别 CaaX 基序(C=半胱氨酸, a=脂肪族氨基酸, X=决定特异性的残基);香叶基香叶基转移酶 I 型和 II 型(GGTase-I/II)以香叶基二磷酸(GGPP)为底物。S-异戊烯化蛋白中最大的一类是小 G 蛋白(Ras、Rho、Rab 家族),它们在癌症和微生物感染中起关键作用。

S-异戊烯化位点鉴定的核心目标是:在已知的特定蛋白上,精确鉴定异戊烯化修饰发生在哪一个半胱氨酸残基上,并区分法尼基化和香叶酰化。

法尼基化与香叶酰化

S-异戊烯化主要分为两种类型,由不同的酶催化,识别不同的基序:

法尼基化(Farnesylation)

脂链:法尼基(Farnesyl, 15-碳异戊二烯)

催化酶:法尼基转移酶(FTase)

识别基序:CaaX(X = Ser/Met/Gln/Ala)

生物学功能:Ras 蛋白膜定位、核纤层蛋白加工

典型底物:H-Ras、N-Ras、K-Ras、Lamin B

FTaseFPPCaaXRas

香叶酰化(Geranylgeranylation)

脂链:香叶基香叶基(Geranylgeranyl, 20-碳异戊二烯)

催化酶:GGTase-I(CaaX, X = Leu)/ GGTase-II(CC/CXC)

识别基序:CaaX(X = Leu)或 CC/CXC 基序

生物学功能:Rho/Rab 蛋白膜定位、囊泡运输

典型底物:RhoA、Rac1、Cdc42、Rab 家族

GGTaseGGPPCC/CXCRho/Rab

技术方案

S-异戊烯化位点鉴定通过化学报告基团(叠氮/炔基)标记策略,利用生物正交反应实现修饰蛋白的特异性检测和富集。标准流程如下:

代谢标记叠氮/炔基异戊二烯类似物标记
→
点击化学生物正交反应连接生物素
→
亲和富集链霉亲和素珠富集修饰蛋白/肽段
→
LC-MS/MS高分辨质谱采集
→
位点定位异戊烯化位点确认
S-异戊烯化修饰类型与 FTase/GGTase 催化机制 S-异戊烯化位点鉴定化学报告基团标记流程

服务优势

  • 化学报告基团标记

    采用叠氮/炔基异戊二烯类似物替代放射性底物,安全高效,灵敏度高,通过点击化学反应连接生物素或荧光基团。

  • 法尼基/香叶酰区分

    通过使用不同的报告基团底物(Az-FPP vs Az-GGPP),可区分法尼基化和香叶酰化修饰。

  • 靶向精准

    针对已知目标蛋白进行定向分析,结果精确到具体半胱氨酸残基。

  • 高分辨质谱平台

    采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统,确保异戊烯化修饰肽段检测的灵敏度和位点定位精度。

送样要求

常规动物组织:100mg

软体动物组织:1g

常规植物组织:1g

植物果实及种子:2g-4g

细胞样本:2×107

菌类样本:150mg

最低蛋白质量:1mg

检测平台:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统

位点鉴定因针对特定蛋白,样本量要求相对灵活,支持血清、重组蛋白等特殊样本,具体请咨询技术团队。

详细送样指南请参考 送样准备。

Aimsmass送样准备示意图

常见问题

S-异戊烯化位点鉴定和异戊烯化蛋白质组学有什么区别?

位点鉴定针对已知的特定目标蛋白,精准定位异戊烯化发生在哪个半胱氨酸残基上。蛋白质组学则在全蛋白水平进行系统性分析。已知目标蛋白选位点鉴定,探索未知选蛋白质组学。

如何区分法尼基化和香叶酰化?

两种修饰的脂链长度不同(15-碳 vs 20-碳),可使用不同的叠氮标记底物(Az-FPP 或 Az-GGPP)分别进行代谢标记。质谱分析中,两种修饰的质量偏移也不同,可通过高分辨质谱区分。

送样要求是什么?

需要提供新鲜培养的细胞(≥ 1×107)进行代谢标记。也可提供纯化的目标蛋白进行体外异戊烯化反应。标记时间通常为 4-24 小时。

FTase 抑制剂(如 FTI-277)可以用来验证吗?

可以。FTase 抑制剂(FTI-277)可特异性抑制法尼基化,GGTase 抑制剂(GGTI-298)可特异性抑制香叶酰化。通过比较抑制剂处理前后的修饰水平,可验证异戊烯化类型和特异性。

项目周期多长?

标准交付周期约 1-2 周。交付内容包括:原始质谱数据、异戊烯化位点定位结果表、修饰肽段序列、关键质谱谱图。

相关服务

如需在全蛋白水平进行系统性S-异戊烯化分析,或对其他修饰类型进行研究,可参考以下服务:

已有目标蛋白?定制S-异戊烯化位点鉴定方案

提交咨询,Aimsmass 技术团队将根据您的目标蛋白和研究目的,定制精准的S-异戊烯化位点鉴定方案与报价。

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