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AIMS 专业服务

巴豆酰化蛋白质组学

基于 LC-MS/MS 高通量质谱平台,系统性绘制生物样本中的巴豆酰化修饰景观图谱,揭示蛋白质翻译后修饰调控网络。

Thermo Fisher 高分辨质谱 LC-MS/MS 全局分析 系统性修饰景观图谱
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巴豆酰化概述

赖氨酸巴豆酰化是一种新发现的组蛋白 PTM,它在哺乳动物细胞基因组中的活性基因启动子和潜在增强子处特异性富集。巴豆酰化可由蛋白质巴豆酰转移酶和脱巴豆酰化酶可逆催化。赖氨酸的巴豆酰化首先在组蛋白上被发现,之后更多的真核非组蛋白被鉴定为巴豆酰化[1]。

巴豆酰化可能对疾病发展产生不同的调节作用,具体取决于所涉及的特定组织、器官、细胞和细胞微环境。与蛋白质赖氨酸酰化修饰(如乙酰化和琥珀酰化)类似,巴豆酰化可以通过酶或非酶反应进行调节。Cr-CoA 被认为是巴豆酰化修饰的供体,其短链脂肪酸合成来源于巴豆酸盐[2]。

蛋白巴豆酰化修饰的组蛋白调控机制示意图

巴豆酰化蛋白质组学的研究价值

巴豆酰化(Crotonylation)是 2011 年由赵英明教授团队鉴定的一种新型组蛋白酰化修饰,由巴豆酰辅酶 A 作为酰基供体将巴豆酰基团共价连接到蛋白质赖氨酸残基上。巴豆酰化修饰在活性基因启动子区域的富集程度超过乙酰化,被认为是比乙酰化更强的转录激活标记。[3]

巴豆酰化蛋白质组学通过系统性鉴定巴豆酰化位点,揭示该修饰在基因表达调控和生殖生物学中的功能。组蛋白巴豆酰化在精子形成过程中的全局性升高提示其在雄性生殖中的重要角色,为非组蛋白巴豆酰化的功能研究开辟了方向。[4]

N 转录激活与基因调控

组蛋白巴豆酰化(如 H3K14cr)在活性基因启动子和增强子区域高度富集,其转录激活效能强于对应的乙酰化修饰。巴豆酰化蛋白质组学可系统性绘制巴豆酰化修饰景观,揭示其转录调控网络。

I 生殖生物学

雄性生殖细胞减数分裂后,组蛋白巴豆酰化水平全局性升高,可能参与精子染色质重塑和基因沉默。这一发现为理解雄性不育的表观遗传机制提供了新视角。

C 代谢与肿瘤

巴豆酰辅酶 A 是脂肪酸 β-氧化的中间代谢物,其水平受细胞代谢状态调控。代谢应激条件下巴豆酰化修饰的变化反映了代谢与表观遗传之间的动态联系,在肿瘤代谢研究中具有潜在价值。

Aimsmass 技术方案

Aimsmass 基于专业的 LC-MS/MS 质谱平台,提供巴豆酰化蛋白质组学服务,可对生物样本进行全局巴豆酰化修饰定性分析。

巴豆酰化修饰富集与质谱鉴定

采用巴豆酰化赖氨酸特异性抗体(anti-Kcr)进行免疫亲和富集。富集后的肽段经高分辨 LC-MS/MS 分析,结合可变修饰搜库策略(+68.026 Da),系统性鉴定巴豆酰化修饰位点。

巴豆酰化蛋白质组学定量策略对比

在全局鉴定巴豆酰化修饰位点的基础上,定量分析可进一步比较不同生理/病理状态下修饰水平的动态变化。Aimsmass 提供多种定量策略供选择:

对比维度Label-free 非标记定量iTRAQ/TMT 标记定量DIA 数据非依赖采集
样本通量无限制,灵活多样最多 16 个样本同时标记无限制,适合大队列
定量精度中等,需较多技术重复高,多通道内标校正高,谱图库辅助定量
成本最低,无试剂费用较高,需标记试剂中等
适用场景样本量大、预算有限的探索性研究精确比较少量样本间的修饰差异大队列临床样本、时间序列研究
推荐Aimsmass 技术团队会根据您的实验设计和样本数量推荐最优定量方案
选择方法 & 咨询报价 或拨打 021-51914748

数据交付内容

修饰位点鉴定列表

包含修饰蛋白名称、修饰位点位置、修饰肽段序列、鉴定置信度评分(FDR 控制)。

原始质谱数据

提供全部 LC-MS/MS 原始数据文件(.raw/.mzML),支持后续独立数据分析与验证。

搜库结果与质控报告

数据库搜索结果(含搜库参数说明)、质控指标汇总(肽段/蛋白 FDR、鉴定数量统计)。

增值分析(可选)

差异修饰定量分析、GO 功能注释、KEGG 通路富集、蛋白互作网络分析等生信分析报告。

Thermo
高分辨质谱平台
4-6
周常规服务周期
1%
肽段级 FDR 控制
LC-MS/MS
高通量检测

送样要求

样本类型送样量/每个样本
常规动物组织100mg
软体动物组织1g
常规植物组织1g
植物果实及种子2g-4g
细胞样本2×107
菌类样本150mg
最低蛋白质量:1mg

* 具体的样本制备和保存要求请参考送样指南,或联系技术支持获取定制化送样方案。

检测平台:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统 + HPLC-MS/MS

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相关蛋白质组学服务

  1. Xie Y, Hu H, Liu M, Zhou T, Cheng X, Huang W, Cao L. The role and mechanism of histone lactylation in health and diseases. Front Genet. 2022;13:949252. DOI:10.3389/fgene.2022.949252 乳酸化
  2. Wan J, Liu H, Chu J, Zhang H. Functions and mechanisms of lysine crotonylation. J Cell Mol Med. 2019;23(11):7163-7169. DOI:10.1111/jcmm.14650 酰基化
  3. Xu Y, Shi Z, Bao L. An Expanding Repertoire of Protein Acylations. Mol Cell Proteomics. 2022;21(3):100193. DOI:10.1016/j.mcpro.2022.100193 综述

常见问题

巴豆酰化蛋白质组学服务有什么优势?

操作容易简单,不需同位素标记,实验流程简单。高精度与准确性,可全局绘制修饰景观图谱,采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统,获取更多肽段信息,找到更多修饰位点。检测范围广,可系统性绘制各种细胞或组织中巴豆酰化修饰景观图谱。

样本送样要求是什么?

常规动物组织 100mg,软体动物组织 1g,常规植物组织 1g,植物果实及种子 2g-4g,细胞样本 2×107 个,菌类样本 150mg,最低蛋白质量 1mg。具体的样本制备和保存要求请参考送样指南。

巴豆酰化蛋白质组学服务周期一般多长?

常规服务周期为 4-6 周,包含样本前处理、修饰富集、LC-MS/MS 检测和数据分析全流程。如样本量较大或有特殊需求(如多组学联用),周期可能适当延长。具体时间安排可在咨询时与 Aimsmass 技术团队确认。

交付的数据包含哪些内容?

标准交付内容包括:巴豆酰化修饰位点鉴定列表(含修饰蛋白名称、位点位置、肽段序列、FDR 评分)、LC-MS/MS 原始数据文件(.raw/.mzML)、搜库结果与质控报告(含搜库参数和鉴定统计)。可选增值服务包括差异修饰定量分析、GO 功能注释、KEGG 通路富集等生信分析报告。

组学发现后如何验证目标巴豆酰化位点?

Aimsmass 提供配套的巴豆酰化位点鉴定技术服务和验证试剂盒,可通过 Western Blot、定点突变和功能实验对组学发现的目标位点进行独立验证,形成"组学发现 → 靶向验证"的完整研究闭环。

一次实验能鉴定多少巴豆酰化修饰位点?

鉴定数量取决于样本类型、蛋白复杂度和修饰丰度。一般情况下,单次实验可鉴定数百至数千个巴豆酰化修饰位点。采用高深度分级分离策略可进一步提高鉴定覆盖度。Aimsmass 技术团队会根据研究目标推荐最优方案。

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选择修饰类型,最多 3 种;费用因修饰不同而异

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