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AIMS 专业服务

糖基化位点鉴定

针对特定目标糖蛋白,精准定位 N-糖基化和 O-糖基化修饰发生的精确氨基酸残基。Aimsmass 基于 HILIC/凝集素富集与 EThcD/HCD 双碎裂 LC-MS/MS 平台,从肽段水平确认糖基化位点及糖链组成,为糖蛋白功能研究和生物药质量评价提供分子水平的确切证据。

N+O糖型同步覆盖
~1-2 周标准交付周期
双碎裂EThcD+HCD
首页 / 定制服务 / 糖基化位点鉴定

本页面是糖基化「位点鉴定」服务入口。如果您已有明确的目标糖蛋白(如特定抗体、受体或血清蛋白),需要精确定位其上的糖基化位点及糖链组成,请在此选择对应服务。如需在全蛋白水平进行系统性糖基化全景分析,请访问 糖基化蛋白质组学。

糖基化是最常见的翻译后修饰之一,估计超过 50% 的真核蛋白存在糖基化修饰。与磷酸化等模板型修饰不同,糖基化属于非模板型修饰——同一氨基酸位点可连接多种不同糖链结构(糖型),产生显著的微观异质性。这种位点特异性糖型分布直接影响蛋白的折叠、稳定性、亚细胞定位和生物学活性。

糖基化位点鉴定的核心目标是:在已知的特定糖蛋白上,精确鉴定糖基化发生在哪一个氨基酸残基上,同时解析该位点连接的糖链组成,从而为后续的功能验证、药物开发或质量控制提供分子水平的确凿证据。

如何选择位点鉴定还是蛋白质组学?

在开始实验前,请根据您的研究目标选择合适的服务类型:

对比维度 位点鉴定(本页面) 糖基化蛋白质组学
目标蛋白 已知,有明确研究糖蛋白 未知 / 全蛋白水平探索
样本量 较少即可 需更多样本
产出结果 精确到残基的糖基化位点 + 糖链组成 全糖基化景观图谱 + 定量分析
交付周期 ~1-2 周 3-4 周
适用场景 验证已知糖蛋白修饰位点、生物药糖型评价 发现新糖基化位点、系统性全景分析

如需全蛋白水平的系统性糖基化分析,请访问 糖基化蛋白质组学(Glyco-DIA)。

N-糖基化与 O-糖基化

哺乳动物蛋白糖基化主要分为两大类,在连接方式、结构特征和分析策略上各有不同:

N-糖基化

连接位点:天冬酰胺(Asn)残基

共识序列:Asn-X-Ser/Thr(X 非脯氨酸)

结构特征:五糖核心结构保守,外周糖链多样化(高甘露糖型、复杂型、杂合型)

分析策略:可用 PNGase F 酶切释放糖链,将 Asn 转为 Asp(质量偏移 +0.984 Da),通过质量偏移确认糖基化位点

典型蛋白:IgG Fc 段(Asn297)、转铁蛋白、甲胎蛋白(AFP)

PNGase F 酶切 HILIC 富集 凝集素亲和

O-糖基化

连接位点:丝氨酸/苏氨酸(Ser/Thr)残基

共识序列:无明确共识序列

结构特征:Core1-Core8 等多种核心结构,黏蛋白型 O-糖最为常见

分析策略:无通用释放酶,需 EThcD 碎裂直接获取肽段骨架 c/z 离子定位位点,解析难度更高

典型蛋白:黏蛋白(MUC1/MUC16)、IgA1 铰链区、Notch 受体

EThcD 碎裂 无通用释放酶 HCD 辅助

Aimsmass 标配 EThcD+HCD 双碎裂模式,一次采集同时获取糖链组成(HCD 氧鎓离子)与精确位点(EThcD c/z 离子),解决纯 HCD 无法精确定位 O-糖位点的行业通病。

技术方案

糖基化位点鉴定针对特定目标蛋白,通过特异性富集糖肽后进行 LC-MS/MS 分析,精确定位修饰位点及糖链组成。标准流程如下:

蛋白提取目标蛋白纯化/富集
→
酶切消化胰蛋白酶肽段制备
→
糖肽富集HILIC/凝集素亲和
→
LC-MS/MSEThcD+HCD 双碎裂
→
位点定位糖链组成+位点确认
糖基化糖肽分析流程:糖蛋白酶解 → Label-Free MS¹ 采集 → Data Dependent MS² → 软件解卷积

富集策略

  • HILIC 亲水相互作用富集

    利用糖链的亲水性质,通过 HILIC 色谱柱选择性富集糖肽。适用范围广,对 N-糖和 O-糖肽均有良好富集效果,是目前最通用的糖肽富集方法。

  • 凝集素靶向富集

    利用特定凝集素(如 ConA、WGA、PNA 等)与糖链结构的特异性结合进行靶向富集。适用于特定糖型的定向分析,如 ConA 富集高甘露糖型、WGA 富集唾液酸化糖链。

  • PNGase F 酶切辅助鉴定(N-糖专用)

    通过 PNGase F 在 H2(18)O 中酶切释放 N-糖链,使 Asn 转为 Asp 并产生 +2.989 Da 的质量偏移,直接通过质谱质量偏移确认糖基化位点。适用于 N-糖位点的快速确认。

Aimsmass 糖基化位点鉴定技术平台示意图

服务优势

  • N/O 糖同步覆盖

    标配 EThcD+HCD 双碎裂模式,HCD 产生糖链特征氧鎓离子用于鉴定糖链组成,EThcD 保留肽段骨架 c/z 离子用于精确定位修饰位点。一次实验同时覆盖 N-糖和 O-糖位点,解决纯 HCD 无法精确定位 O-糖的行业通病。

  • 靶向精准

    针对已知目标糖蛋白进行定向糖基化分析,结果精确到具体氨基酸残基及糖链组成,直接服务于功能验证研究和生物药质量评价。

  • 快速高效

    仅需提供足量目标蛋白,标准周期约 1-2 周即可交付数据。支持血清、重组蛋白等特殊样本类型。

  • 高分辨质谱平台

    采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统,确保糖肽检测的灵敏度和位点定位精度。

送样要求

常规动物组织:100mg

软体动物组织:1g

常规植物组织:1g

植物果实及种子:2g-4g

细胞样本:2×107

菌类样本:150mg

最低蛋白质量:1mg

检测平台:Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200,扫描速度 40 Hz),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统

糖基化位点鉴定因针对特定蛋白,样本量要求相对灵活,支持血清、重组蛋白等特殊样本,具体请咨询技术团队。

详细送样指南请参考 送样准备。

Aimsmass送样准备示意图

常见问题

糖基化位点鉴定和糖基化蛋白质组学有什么区别?

位点鉴定针对已知的特定目标糖蛋白,精准定位糖基化发生在哪个天冬酰胺(N-糖)或丝/苏氨酸(O-糖)残基上,适用于已有明确研究目标的场景。蛋白质组学(Glyco-DIA)则在全蛋白水平进行系统性糖基化分析,无需预设目标,适合探索性研究和发现新的糖基化位点。简单来说:已知糖蛋白选位点鉴定,探索未知选蛋白质组学。两者可配合使用——先通过组学发现候选位点,再用位点鉴定进行靶向验证。

N-糖基化和 O-糖基化位点鉴定有什么不同?

N-糖基化发生在天冬酰胺(Asn)残基上,共识序列为 Asn-X-Ser/Thr,可用 PNGase F 酶切释放糖链后进行位点鉴定,技术相对成熟。O-糖基化发生在丝氨酸/苏氨酸(Ser/Thr)残基上,无明确共识序列,且无通用释放酶,需采用 EThcD 碎裂直接获取肽段骨架信息来定位位点,解析难度更高。Aimsmass 标配 EThcD+HCD 双碎裂模式,可同时覆盖 N 糖和 O 糖位点。

送样要求是什么?

常规动物组织 100mg,软体动物组织 1g,常规植物组织 1g,植物果实及种子 2g-4g,细胞样本 2×107 个,菌类样本 150mg,最低蛋白质量 1mg。糖基化位点鉴定因针对特定蛋白,样本量要求相对灵活,支持血清、重组蛋白等特殊样本,具体可咨询技术团队。

项目周期多长?交付哪些内容?

标准交付周期约 1-2 周,从样本接收到数据报告交付。交付内容包括:原始质谱数据(.raw)、糖基化位点定位结果表(含位点置信度)、糖链组成信息、关键质谱谱图。如需生信下游分析可另行沟通。

数据质量如何保证?

采用 Thermo Fisher Orbitrap Exploris 480 / Q Exactive HF-X 高分辨质谱仪(分辨率 240,000 @ m/z 200),搭配 EASY-nLC 1200 纳升液相色谱系统。HCD 碎裂获取糖链特征氧鎓离子,EThcD 碎裂获取肽段骨架 c/z 离子,双重验证确保位点定位置信度(localization probability)≥ 0.75。

相关服务

如需在全蛋白水平进行系统性糖基化分析,或对其他修饰类型进行研究,可参考以下服务:

已有目标糖蛋白?定制靶向糖基化位点鉴定方案

提交咨询,Aimsmass 技术团队将根据您的目标糖蛋白和研究目的,定制精准的糖基化位点鉴定方案与报价。

获取位点鉴定方案与报价

电话:021-51914748 | 邮箱:info@aimsmass.cn